El Colegio Juan XXIII es una creación de la Pontificia Universidad Católica Madre y Maestra. Inicia sus labores el 7 de septiembre de 1992, como un Centro Educativo de Educación Media, con la modalidad del bachillerato  científico-humanista.

Con el nacimiento del Colegio se cumple un sueño de muchos años forjado por la PUCMM, de contribuir a enriquecer la oferta de Educación Media de calidad en la comunidad de Santiago, satisfaciendo así una necesidad sentida y las expectativas de amplios sectores de la población.

Reconociendo la calidad académica y condiciones físicas de su plantel, la Secretaría de Educación, por Resolución No. 273’96, confiere al Colegio Juan XXIII facultad para conducir sus propias pruebas.

Con su nombre se ha querido perpetuar la memoria del muy querido y respetado Papa Juan XXIII, que proclamó el derecho del joven a una mejor calidad de vida. Reconociendo en la supremacía del hombre y la mujer agentes de esperanza y futuro para la humanidad.

El Colegio Juan XXIII está ubicado al sureste del campus de la Pontificia Universidad Católica Madre y Maestra, en donde los(as) estudiantes pueden disfrutar de un área amplia y acogedora, en contacto directo con la naturaleza.